Ada jalur metabolisme tertentu yang dapat didefinisikan untuk mengidentifikasi konstruksi molekul tertentu.
Jalur asam sichimic: jalur metabolisme sekunder yang memiliki asam scichimic sebagai prekursornya, sebuah molekul yang mengandung karakteristik struktural dan kimia yang dapat ditemukan dalam metabolit sekunder yang berasal darinya.
Molekul asam skichimat terdiri dari: cincin beranggota 6, 1 gugus karboksilat dan gugus hidroksil 3. Arsitektur molekul yang sama ini dapat ditemukan pada metabolit sekunder yang berasal darinya, dan yang sebenarnya disebut turunan dari asam.sikimat. Asam scichimic berasal dari penyatuan dua intermediet dari dua jalur metabolisme primer yang berbeda:
erythrosium-4-phosphate (3C): perantara fase gelap fotosintesis, proses metabolisme anabolik;
asam fosfoenolpiruvat (3C): zat antara glikolisis, proses metabolisme katabolik;
Oleh karena itu, erythrosium-4-phosphate + phosphoenolpyruvic acid = scichimic acid: prekursor pertama dari jalur metabolisme sekunder.
Sel mensintesis asam skichimat ketika kebutuhan seperti untuk memungkinkannya, atau ketika jumlah dua intermediet primer begitu banyak dan sedemikian rupa sehingga mereka dapat terakumulasi; ini terjadi ketika ada cukup jumlah ATP di dalam sel dan ini memperlambat reaksi katabolisme primer dan anabolisme.
Jalur asam malonat dan mevalonat: kedua prekursor berasal dari molekul Asetil KoA, oleh karena itu keduanya mendasari jalur tunggal: jalur asetat Asetil KoA adalah molekul penghubung antara glikolisis dan siklus Krebs dan oleh karena itu kita dapat mendefinisikannya sebagai perantara dari metabolisme primer sel.
Gugus asetat (gugus dengan dua atom karbon) + KoA (koenzim A) = Asetil KoA: molekul yang termasuk dalam metabolisme primer, yang digunakan sebagai blok bangunan biologis dalam konstruksi metabolit sekunder.
Jalur asetat kemudian dibedakan dengan jalur asam malonat dan jalur asam mevalonat.Koenzim A bertindak sebagai transportasi dua unit karbon dari sitoplasma ke mitokondria sel, di mana siklus Krebs berlangsung.karbon malah diangkut ke tempat lain dalam kasus kelebihan energi dan dapat menjadi metabolit sekunder yang paling bervariasi; ini memiliki jumlah atom karbon yang genap sebagai karakteristik umum, termasuk asam malonat (C4) dan mevalonat (C6 ).
Oleh karena itu, jalur metabolisme asam skichimat dan asetat memiliki arsitektur molekul yang tepat, yang memungkinkan kita untuk dengan mudah mengidentifikasi turunan sekundernya. Untuk NS alkaloid, yang memiliki arsitektur beragam, identifikasi prekursor tidak begitu mudah, dengan kata lain, tidak begitu mudah untuk mengklasifikasikan kategori tunggal alkaloid, menelusuri masing-masing ke prekursor tunggal.Alkaloid, pada kenyataannya, memiliki lebih dari satu prekursor, karena mereka berasal dari asam amino (senyawa nitrogen primer, yang digunakan sel untuk menghasilkan molekul nitrogen sekunder) Metabolit nitrogen sekunder terutama alkaloid, tetapi ada juga molekul lain dengan profil kesehatan yang lebih rendah daripada mereka sendiri, seperti sianogenik glikosida (terkandung dalam almond pahit) dan -sianos (pigmen) Asam amino adalah senyawa nitrogen yang terdiversifikasi satu sama lain dan keragaman ini mencerminkan diversifikasi turunan langsungnya, yaitu alkaloid.
Satu-satunya unsur kimia yang menyatukan berbagai kategori alkaloid adalah atom nitrogen yang terbungkus dalam cincin heterosiklik, atau setidaknya atom nitrogen dengan elektron ganda bebas yang memberi mereka sifat dasar; reaktivitas dasar yang sama yang memungkinkan kita mengekstrak alkaloid individu oleh perpindahan.
Kita dapat menyimpulkannya dengan mengatakan bahwa jalur karbohidrat adalah jalur metabolisme yang mendasari sintesis semua metabolit sekunder, oleh karena itu mencakup semua jalur metabolisme yang sebelumnya terlihat:
- asetat adalah produk dari penghancuran total molekul glukosa;
- asam amino berasal dari proses metabolisme degradasi karbohidrat;
- asam scichimic adalah prekursor metabolit sekunder, tetapi juga asam amino aromatik (fenilalanin, triptofan dan tirosin);
-glikosida adalah metabolit sekunder yang terdiri dari gula ditambah unit non-gula, yang disebut aglikon, yang mungkin berasal dari salah satu jalur metabolisme yang diringkas.
Semua blok bangunan biogenetik dari mana metabolit sekunder berasal berasal baik dari katabolisme karbohidrat atau dari anabolisme mereka. Gula ini adalah unit gula yang sama yang pernah dikaitkan dengan aglikon membentuk glikosida.
Jalur metabolisme asetat dibagi menjadi pohon biogenetik padat, yang berisi semua nama metabolit sekunder yang dihasilkannya berbeda, tergantung pada kebutuhan sel itu sendiri:
- Siklus Krebs dengan produksi akhir ATP (metabolisme primer);
- -oksidasi dan sintesis asam lemak (metabolisme primer);
- Sintesis malonat atau asam malonat (4C), yang berasal dari penyatuan dua molekul asetat, dan mevalonat atau asam mevalonat (6C) yang berasal dari penyatuan tiga molekul asetat. Sel menggunakan dua molekul ini dengan jumlah atom karbon yang genap untuk membangun kategori molekul yang berbeda, yang terdiri dari rantai linier unit hidrokarbon, seperti: asam lemak - digunakan untuk menghasilkan gliserida dan lilin - terpenoid, antrakuinon, dan steroid.
Artikel lain tentang "Biogenesis dan karakteristik bahan aktif"
- Metabolisme primer dan metabolisme sekunder tumbuhan
- Farmakognosi
- Jalur metabolisme asam schimic